日前,中國政府采購網發布四川大學生物治療國重實驗室冷凍電鏡平臺數據處理及存儲計算集群建設采購項目公開招標公告(招標編號:JJCDCG-2018121901;采購人備案編號:SCUSBC-2018043),預算800萬元進行冷凍電鏡大數據云計算平臺及配套設備設施建設,開標時間:2019年03月12日 10:00
冷凍電鏡數據計算存儲平臺建設項目是四川大學生物治療國家重點實驗室冷凍電鏡平臺附屬配套工程,為今后冷凍電鏡大數據存儲、計算、在線分析提供支持,項目包括高性能計算功能、大數據存儲與在線管理等設備的采購、后期各項應用軟件的培訓、以及機房環境改造與建設。項目建成后將成為冷凍電鏡平臺在線三維數據分析處理中心,為科研團隊提供冷凍電鏡數據的在線計算和存儲、以及配套技術服務。
招標內容如下:
招標公告中對項目的需求進行了如下描述:采購、部署一套高性能計算集群,包含計算功能、存儲功能、在線數據處理功能、在線遠程3DLinux 桌面云功能、校內在線計算與存儲功能、集群管理與多用戶作業隊列管理功能、用戶存儲配額管理功能、配套機房設施/網絡/綜合布線系統工程與配套設施設備。計算與存儲功能配套的計算機性能要求見配置功能要求。供應商必須提供集群系統的設計、實施、運營維護、售后服務、駐場技術支持服務的詳細方案。
對于冷凍電鏡數據處理技術支持服務要求:供應商必須針對冷凍電鏡數據采集、預處理、分析處理、三維重構、數據三維可視化等環節設計、部署全自動化數據處理流程(Pipeline),包括但不限于數據收集軟件SerialEM、數據處理軟件(MotionCor2、CtfFind4、RELION3、EMAN、EMAN2、cryoSPARC、cisTEM)、Tomo 專用軟件(IMOD、EMClarity)、以及建模軟件(Coot、Rosetta、Phenix、Pymol、CCP4)等具體軟件的腳本編寫與軟件代碼級別性能調優。