質譜成像與代謝組學實驗室以中央民族大學“生物成像與系統生物學研究中心”為科研平臺，主要依托北京高校高精尖學科“質譜成像與代謝組學”，并整合生命與環境科學學院和藥學院的化學、生物學、中藥學及民族醫藥學等相關學科資源推進建設與發展。該實驗室將圍繞關鍵科學問題和前沿技術難題，聚焦分析新技術、新方法的研究；整合質譜成像與代謝組學技術，發展前沿與新興交叉平臺體系；拓展相關技術與方法在精準醫學、疾病生物標志物、藥物研發、民族醫藥、細胞分析、藥用植物等領域的應用途徑。此外，加強與清華大學、中國醫學科學院藥物研究所等優勢單位合作，推進智能化代謝物成像與原位分析質譜裝置的研制。

民族地區生態環境實驗室依托生命與環境科學學院，通過研究少數民族地區的生態系統、生物多樣性及相關傳統知識、土地利用、污染防治與水資源管理等方面的生態問題和環境問題，針對民族地區面臨的生態環境保護和脫貧攻堅難題，聚焦民族地區生態環境的共性和關鍵問題，開展前瞻性、綜合性研究，為民族地區生態文明建設、生態保護、環境治理和經濟社會可持續發展提供知識和技術支持。